以下是灭菌烘箱选型的一般原则，很难说哪一项或哪几项是重要的，理想的选型必须根据自己的条件有所侧重，有时折中是必要的。
1.适用性-------灭菌烘箱首先必须能适用于特定物料，且满足物料干燥的基本使用要求，包括能很好的处理物料（给进、输送、流态化、分散、传热、排出等），并能满足处理量、脱水量、产品质量等方面的基本要求。
2.干燥速率高---仅就干燥速率看，对流干燥时物料高度分散在热空气中，临界含水率低，干燥速度快，而且同是对流干燥，干燥方法不同临界含水率也不同，因而干燥速率也不同。
3.耗能低-------不同干燥方法耗能指标不同，一般传导式干燥的热效率理论上可达100%,对流式干燥只能70%左右。
4.节省投资-----完成同样功能的干燥装置，有时其造价相差悬殊，应择其低者选用。
5.运行成本低---设备折旧、耗能、人工费、维修费，备件费…等运行费用要尽量低廉。
6.优先选择结构简单、备品备件供应充足、可靠性高、寿命长的干燥装置。
7.符合环保要求，工作条件好，安全性高。
8.选型前能做出物料的干燥实验，深入了解类似物料已经使用的干燥装置（优缺点），往往对恰当选型有帮助。