医疗废水污泥处理用聚丙烯酰胺，聚丙烯酰胺是絮凝剂的一种。医疗废水处理难度一般很大，处理起来比较复杂。只有在废水中污泥脱水，污水处理环节用到絮凝剂，其污水中使用的其他药剂也非常之多。而且不同的医院污水的水质也是不一样的。
絮凝剂能用于各种污水处理，但医院里的废水污水不同于生活污水，它的成分是非常复杂的，含有多种药物残渣如消毒剂等等，来自化验、检验、手术各科室的重金属、有机试剂等；还含有多种病菌病毒以及寄生虫卵。它们在环境中具有一定的适应力，有的甚至在污水中存活时间较，若未经处理即排入水体或用于灌溉，将会严重污染环境，影响人民身体健康。医院污水特点还体现在综合污水BOD5/CODcr高，可生化性较强，溶解性CODcr占有很大比例，适合于生物法进行处理。
医院医疗废水处理一般采用“调节池—生化处理—沉淀池--二氧化氯消毒”作为主体处理工艺。化粪池出来的废水经过格栅处理大的悬浮固体后流入调节池，在调节池内调节水量和水质，同时还进行厌氧水解，将部分大分子有机物降解微小分子有机酸；经水解后的水流进生物接触氧化池进行生物处理，经生物处理后出水进入沉淀池，沉淀池的水通过水泵提升进入接触消毒池，同时消毒剂与水泵联动进行同步投加，后出水达标排放。
医疗废水中使用的絮凝剂主要是聚丙烯酰胺和聚合氯化铝。其废水经过消毒后在进行废水沉降等过程。处理原理与其他的废水工艺一样。由于废水中COD含量高，所以要用阳离子聚丙烯酰胺和聚合氯化铝，这样排放的医疗污水才能达到排放标准，不危害环境。
阳离子聚丙烯酰胺在使用之前一般都需配制成0.1 %～0.5%的稀释溶液备用，配制好的溶液好不要存放太长时间才用，这个浓度范围的溶液在使用之前还需要近一步稀释成0.01～0.05的溶液，原因是可以更有助于絮凝剂在悬浮体系中的分散，可以降低用量，而且可以取得更好的絮凝效果。
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