植物的大部分营养和水分都是通过根部于土壤进行物质交换完成的，因此根系的生长状态对于植物的影响非常大，研究根系形态对于农业发展而言非常重要，不过根系属于植物“隐藏的一半”，要对其开展研究工作是有一定的难度的，而随着科技的发展，根系分析仪被应用到了植物根系研究当中，研究人员使用它来开展工作，让根系研究变得更轻松，也更有效率。
当然，在根系分析仪出现前，也有学者对植物根系进行研究的，只是以前植物根系研究者在进行根系研究的时候，受到很多外在因素的影响，导致根系研究的进程非常缓慢。而现在有了根系分析仪之后，让研究者更加方便的开展工作，根系分析系统大批量的全自动根系分析，可对各自动分析结果图进行编辑修正；能进行根的分叉裁剪、合并、连接等修正，修正操作能回退，以快速获得100%正确的结果。根系分析系统测量项目主要有，根总长；根平均直径；根总面积；根总体积；根尖计数；分叉计数；交叠计数；根直径等级分布参数；可不等间距地自定义分段直径，自动测量各直径段长度、投影面积、表面积、体积等，及其分布参数；根尖段长分布。
托普云农的根系分析仪可以定量测定根总长；根平均直径；根总面积；根总体积；根尖计数；分叉计数；交叠计数；根直径等级分布参数等指标，使用根系分析仪开展的相关工作，成效也是非常明显的，例如在水稻根系形态特征指标定量分析过程中，通过测定发现，增施氮肥可促进根系生长，明显提高不定根比例；适当控水可促进根系生长明显提高分枝根比例。因此利用它来进一步优化水肥的配比，促进作物的健康成长，是卓有成效的。
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