碳源的补充，在很多污水厂的进水中，总氮偏高，碳氮比远远低于理论计算中的5：1的生物脱氮的基本数据，需要外加碳源来满足。从理论的说法上，最佳的碳源是乙酸钠，但是在实际的调试中，发现乙酸钠的质量问题成为影响生物脱氮的重要因素。乙酸钠在污水厂的采购中副产品居多，对于许多污水厂来说其质量无法有效监控和化验，导致乙酸钠质量良莠不齐，往往在稳定投加运行期间，突然就发现出水的总氮又出现超标了，分析各种原因很难判断，反复尝试后，最终确定是在碳源的选择上，更换了其他供应商的乙酸钠，生物脱氮效果就明显恢复。由于国内复产乙酸钠厂家众多，污水厂在采购药剂时不具备药剂纯度的鉴别能力，经常受到药剂质量变化的干扰。为了避免出现这种情况，建议一定选择国标原料生产的乙酸钠，且有正规生产资质的乙酸钠生产厂家，这样对于污水厂来说，就不需有质量上的担忧，只需认真考虑碳源投加的量和地点即可。
碳源的投加，在一些污水厂运行中是很大的成本支出，为了降低成本，要灵活利用进水的碳源，把进水采取一定的手段配置到反硝化区域，利用进水中的BOD作为碳源，可以适当减少加药量，有效的降低运行成本。这个工作，污水厂可以在厂内进行详细的调研，充分发挥厂内的设施设备优势，进行脱氮的碳源的补充。
