清洗准备室清洗后如何继续输送物料，主要取决于产品生产工艺的要求，这直接影响到清洗准备室的选址。一般情况下，物料应通过气密室进入洁净室（区），气密室通常与洁净区相邻或在洁净区内。因此，洁净生产区与气闸室的室内空气压力应保持在合理的压差。使净化空气从洁净生产区流向制剂室。
. 一般情况下，两扇门通常作为机械联锁开关使用，即一扇门关闭时，另一扇门可以打开；有的简化为非联锁式，由用户自行管理；在药品生产厂，箱体内设有紫外线灯，对转运物料进行消毒；另一扇门只有在一扇门关闭的情况下才能开启，在频繁切换或长时间开启的情况下，箱内还设置了一些带高效过滤器的气帘。
在无菌洁净室中，经常使用直通式灭菌设备来输送物料。这些设备大多是电加热或蒸汽加热。设备的一端打开细菌区的门。进料后，加热灭菌一段时间，然后打开另一端的门将材料从无菌室取出。
另外，在流通过程中，有些需要在洁净的隔墙上开孔，使成品不断地通过墙体输出，使孔洞成为室内净化的薄弱环节。一般的处理方法是增加室内正压，或在河中孔上方设置气幕装置；输送无菌室分装瓶等小物品时，在保证室内正压的前提下，可在孔的两侧设置输送带，且孔内配有紫外线灯。
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